Státní okresní archiv Mělník spravuje k 31.12.2003 1262 archivních fondů a sbírek v celkovém rozsahu 3 457 bm. Jedná se o fondy vzešlé z činnosti institucí, které působily (nebo dosud působí) na území mělnického okresu. K nejvýznamnějším fondům patří:
Státní správa - Okresní úřad Mělník a Kralupy nad Vltavou, Okresní zastupitelstvo Mělník, Archiv města mělníka a archivy dalších měst a obcí (obecní úřady a národní výbory).
Justiční správa - Okresní soud Mělník a Kralupy nad Vltavou, okresní prokuratury, veřejní notáři.
Finanční správa - Berní správa Mělník a Kralupy nad Vltavou, důchodkové kontrolní úřady, Okresní finanční správa Mělník
Školství - okresní školní výbory, základní školy, některé střední školy, místní a újezdní školní rady, učitelské spolky
Církev - římsko katolické farní úřady, církevní spolky
Spolky - Sokol, hasičské spolky, divadelní spolky, sportovní spolky
Cechy - víceoborové cechy v Mělníku, Kostelci nad Labem a Mšeně, živnostenská společenstva
Pozůstalosti význačných osobností - spisovatelé (Sv. Čech, J. Deml), hudební skladatelé (A. Dvořák), učitelé, kněží, národní buditelé.
Aktuální soupis fondů naleznete na stránkách MV ČR - klikněte Zde